این کلیسا در سمت راست رودخانه کورا قرار گرفته است و در قرن پنجم توسط شاه واختانگ گرگاسالی دستور ساخت آن داده شد. بعد ها این کلیسا به دستور شاه جلال الدین خوارزمشاه مورد تخریب قرار گرفت. کلیسای سیونی دارای یک صلیب نینوی مقدس است که نشان مسیحیت ارتودوکس میباشد. نمای داخلی این بنا را شخصی بنام گریگور گاگارین طراحی و نقاشی کرده است. تمامی بناکنندگان کلیسای سیونی در این مکان دفن شده اند.